1. 水生生物科技學群：

Ø  包括李安進老師 (酵素純化及藻類天然物萃取)，陳哲俊老師 (微生物及免疫) ，郭建賢老師(分子生物及分子演化) ，包括吳淑美老師 (魚類重金屬、水族環境適應)，郭世榮老師(魚類分類及生態學)，陳淑美老師 (甲殼類生理、環境生物及藻類)。兼任教師(魚病研究) 。

2. 水產養殖學群：

Ø  包括黃承輝老師 (飼料加工、水域生物營養) ，秦宗顯老師 (水產養殖環境、藥物殘留分析)，賴弘智老師 (水質檢測及管理、淡水溪流魚類保育、藥物環境殘留)，董哲煌老師 (觀賞魚及淡水魚類繁養殖)。