嘉義大學高教深耕計畫為提升學生學習成效，以全方位、多面向的學習扶助措施協助學生，於第一期計畫時組成300個同儕讀書會，培養學生自主學習能力，並輔導經濟不利學生申請高教深耕安心就學獎助學金。其中也包括原住民學生的需求，積極辦理原民家族聚會，111年原住民學生活動參與率為12.5%，相較109年度上升2%，參與度明顯提升。
高教深耕計畫第二期將延續原民生輔導服務，持續積極辦理原住民學生家族聚會、讀書會等活動，結合部落原鄉特色發展為核心，提升原住民學生課業學習成效，並落實原住民學生的生活協助與輔導；112年分別在蘭潭校區及民雄校區辦理8場次活動，超過200人參與。
原住民學生讀書會由原資中心提供專屬讀書空間，由讀書會成員中成績優秀的同學擔任輔導員，在期中考及期末考前輔導課業，並協助申請學務處高教深耕獎助學金之「同儕學習助學金及深耕勤學獎學金」。透過校務研究分析資料顯示，109-111年度輔導成效顯著，原民生退學率逐年下降至2.2%。
嘉大將持續辦理原住民系列活動，建置一個有利於原住民學生學習、成長及發展的友善環境，期許原住民學生不僅在學校內獲得最優質的課業學習、生活輔導與生涯就業之資源和協助，更能保有自身族群文化的豐富性。